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1. Circunstância (O Desafio no Mundo Real)

<p>Diagnóstico molecular das doenças genéticas hereditárias e cromossômicas: mecanismos de variação genômica (polimorfismos de nucleotídeo único - SNPs, pequenas inserções e deleções - indels, variações de número de cópias - CNVs e expansões de microssatélites); diagnóstico molecular de hemoglobinopatias (anemia falciforme com mutação Glu6Val no gene HBB detectada por PCR-RFLP com enzima DdeI), fibrose cística (deleção delta-F508 no gene CFTR) e distrofias musculares; técnicas moleculares complementares: MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) para detecção de grandes deleções e duplicações exon-a-exon, FISH (Hibridização In Situ por Fluorescência) em cromossomos metafásicos e interfásicos, e CGH-array (Hibridização Genômica Comparativa em Microarray) na investigação de atrasos de desenvolvimento neuropsicomotor e anomalias congênitas. Oncogenética molecular e biomarcadores tumorais: bases genéticas do câncer, proto-oncogenes ativados por mutações de ganho de função e genes supressores de tumor inativados pelo modelo dos dois golpes (Two-Hit Hypothesis de Knudson); mutações somáticas versus germinativas; painéis de rastreamento hereditário de câncer de mama e ovário (genes BRCA1 e BRCA2) e síndrome de Lynch (genes de reparo de incompatibilidade de DNA MLH1, MSH2, MSH6, PMS2); oncologia de precisão e terapias-alvo: mutações ativadoras no receptor do fator de crescimento epidérmico (EGFR: deleções no éxon 19 e mutação L858R no éxon 21, e mutação de resistência adquirida T790M) e translocações ALK/ROS1 no adenocarcinoma pulmonar com seleção de inibidores de tirosina-quinase; mutações no códon 12 e 13 do gene KRAS e BRAF V600E no câncer colorretal e melanoma, determinando resistência primária a anticorpos monoclonais anti-EGFR; e biologia molecular nas neoplasias hematológicas: translocação recíproca t(9;22)(q34;q11) gerando o gene de fusão oncogênico BCR-ABL1 no cromossomo Filadélfia da Leucemia Mieloide Crônica (LMC), com monitoramento de doença residual mínima (DRM) quantitativa por RT-qPCR em escala internacional (IS). Biópsia líquida e medicina personalizada: conceito, isolamento e análise de DNA tumoral circulante (ctDNA / cell-free DNA - cfDNA) e células tumorais circulantes (CTCs) a partir de plasma periférico; detecção precoce de mecanismos de resistência farmacológica sem necessidade de biópsia tecidual invasiva por droplet digital PCR (ddPCR / PCR digital em gotas) e painéis ultrassensíveis de NGS. Boas práticas e controle analítico em biologia molecular: arquitetura física laboratorial com fluxo unidirecional rígido de trabalho (Sala 1: Preparo de reagentes e master mix sem DNA; Sala 2: Extração e adição de ácidos nucleicos; Sala 3: Amplificação e detecção de PCR pós-reação); procedimentos para prevenção e descontaminação de amplicons aerossolizados (luz UV germicida, irradiação, hipoclorito de sódio 10% e uso de enzima Uracil-DNA Glicosilase - UDG com incorporação de dUTP); e validação analítica com controles analíticos positivos, negativos e de limite de detecção (LoD).</p>

2. Fundamentos & Conceito Central (Estudos)

Diagnóstico molecular das doenças genéticas hereditárias e cromossômicas: mecanismos de variação genômica (polimorfismos de nucleotídeo único - SNPs, pequenas inserções e deleções - indels, variações de número de cópias - CNVs e expansões de microssatélites); diagnóstico molecular de hemoglobinopatias (anemia falciforme com mutação Glu6Val no gene HBB detectada por PCR-RFLP com enzima DdeI), fibrose cística (deleção delta-F508 no gene CFTR) e distrofias musculares; técnicas moleculares complementares: MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) para detecção de grandes deleções e duplicações exon-a-exon, FISH (Hibridização In Situ por Fluorescência) em cromossomos metafásicos e interfásicos, e CGH-array (Hibridização Genômica Comparativa em Microarray) na investigação de atrasos de desenvolvimento neuropsicomotor e anomalias congênitas. Oncogenética molecular e biomarcadores tumorais: bases genéticas do câncer, proto-oncogenes ativados por mutações de ganho de função e g...

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